Rompecabezas de los jugadores Crack AIDS

En lo que podría ser un avance significativo en la investigación del VIH / SIDA, los jugadores en línea que juegan un juego llamado Foldit han resuelto un problema clave en la estructura de proteínas que ha tenido a los científicos rascándose la cabeza durante años. Y los jugadores lo hicieron en tres semanas. Puede leer una cuenta científica de cómo los investigadores reclutaron jugadores de Foldit para trabajar en el problema de modelado y finalmente resolver la estructura cristalina de la proteasa retroviral M-PMV en un artículo publicado en línea esta semana en la revista Naturaleza estructural y biología molecular.
Foldit invita a los jugadores a predecir las estructuras de proteínas. El juego fue desarrollado por investigadores de la Universidad de Washington, como una forma deliberada de lograr que los jugadores compitan resolviendo problemas científicos. El juego requiere que utilicen habilidades de pensamiento espacial y crítico para construir modelos 3D de moléculas de proteínas. En este caso, fueron invitados a construir modelos de M-PMV, una enzima proteasa que desempeña un papel clave en la forma en que un virus similar al VIH se replica en las células. Pocos de los jugadores tenían antecedentes en bioquímica.
Al resolver el misterio de la estructura tridimensional de la proteína, los jugadores han ayudado a los científicos a dar un paso adelante en el desarrollo de un medicamento que podría evitar la propagación de virus como el VIH.
Los investigadores escriben:
"Sorprendentemente, los jugadores de Foldit pudieron generar modelos de calidad suficiente para el reemplazo molecular exitoso y la posterior determinación de la estructura. La estructura refinada proporciona nuevos conocimientos para el diseño de fármacos antirretrovirales".
El estudio es un buen ejemplo de cómo las personas expertas en videojuegos pueden involucrarse en la ciencia y ayudar a resolver una amplia gama de problemas.
En Foldit, los jugadores intentan predecir cómo las proteínas se doblan. Cuando los jugadores juegan el juego, sus acciones para tratar de resolver el problema se registran y se utilizan para crear algoritmos que ayuden a las computadoras a aumentar su razonamiento espacial.
La solución de problemas en el juego ayuda a los científicos a comprender mejor cómo las células producen proteínas, un proceso llamado biosíntesis. Un desafío particular en este campo es comprender cómo ciertas proteínas se pliegan en estructuras tridimensionales.
Para ganar, a los jugadores les debe ir bien en tres factores: qué tan bien empaquetas las proteínas en 3D, cuán eficientemente ocultas los pedazos hidrofóbicos de la molécula y cómo resuelves los choques. Los jugadores no tienen que entender estos factores de esta manera para jugar el juego.
El juego les presenta una nueva proteína y se van, tratando de doblarla para encontrar su forma ideal. Cuando alcanzan un movimiento correcto, que golpea estos factores, obtienen puntos. Los jugadores pueden chatear entre sí en línea y comparar soluciones. Fue a través de estrategias de intercambio que los jugadores de todo el mundo resolvieron el problema M-PMV.
Seth Cooper, diseñador principal de Foldit y coautor del artículo, dijo a la prensa:
"Las personas tienen habilidades de razonamiento espacial, algo en lo que las computadoras aún no son buenas".
"Los juegos proporcionan un marco para unir las fortalezas de las computadoras y los humanos", agregó.
Escrito por Catharine Paddock PhD

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