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El descubrimiento de fármacos contra el cáncer recibe un impulso de la gran base de datos 3D
La adición de mejoras 3D a la base de datos más grande del mundo para la investigación del cáncer y el descubrimiento de fármacos debería ser un gran impulso para los investigadores que buscan formas más efectivas de desarrollar nuevos tratamientos contra el cáncer.
La base de datos ahora contiene las estructuras 3D de casi 3 millones de nichos en la superficie de casi 110,000 moléculas que causan cáncer.
Así concluyen los investigadores que completaron las principales actualizaciones de canSAR, una vasta base de datos de cáncer disponible públicamente que se basa en conocimientos de campos como biología, química, farmacología y biología estructural para ayudar a interpretar datos experimentales y hacer predicciones útiles para el descubrimiento de fármacos.
El equipo, del Instituto de Investigación del Cáncer (ICR) en Londres, Reino Unido, describe las nuevas mejoras de canSAR en la revista Investigación de Ácidos Nucleicos.
Una característica importante de la actualización es la adición de estructuras tridimensionales de proteínas defectuosas y mapas de las redes de comunicación del cáncer.
Otras mejoras incluyen mejores herramientas de navegación y búsqueda, nuevos resúmenes de líneas de enfermedades y cáncer, y herramientas mejoradas de análisis por lotes, señalan los autores del proyecto financiado por Cancer Research UK.
El autor principal, Dr. Bissan Al-Lazikani, quien dirigió el desarrollo de canSAR, y cuya investigación en ICR se enfoca en desarrollar y aplicar técnicas computacionales multidisciplinarias para apoyar el descubrimiento de fármacos, dice:
"Nuestro objetivo es que los científicos del cáncer cuenten con los datos que necesitan para llevar a cabo investigaciones que salvan vidas sobre las drogas más interesantes del futuro".
La base de datos canSAR ha estado funcionando desde 2011 y tiene como objetivo utilizar "big data" para construir una imagen detallada de cómo se comportan la mayoría de las moléculas humanas.
La base de datos ya alberga miles de millones de mediciones experimentales que mapean el efecto de un millón de drogas y productos químicos en las proteínas humanas. También ha adjuntado esta información con datos genéticos y resultados de ensayos clínicos.
El Dr. Al-Lazikani explica por qué el recurso es tan útil:
"Los científicos necesitan encontrar toda la información que existe acerca de un gen o proteína defectuoso para comprender si un nuevo medicamento podría funcionar. Estos datos son vastos y dispersos, pero la base de datos canSAR los reúne y agrega valor identificando enlaces ocultos y presentando la clave información fácilmente ".
La base de datos de descubrimiento de fármacos contra el cáncer más grande del mundo
La última actualización significa que los investigadores, con la ayuda de la inteligencia artificial, pueden buscar nichos útiles en las superficies de moléculas defectuosas que causan cáncer y que podrían ser utilizadas por nuevas drogas para bloquear su efecto.
La base de datos ahora contiene las estructuras 3D de casi 3 millones de nichos en la superficie de casi 110,000 moléculas que causan cáncer.
Otra característica nueva es que los científicos pueden identificar las vías de comunicación para bloquear dentro de las células tumorales.
El Dr. Al-Lazikani dice que la base de datos es la más grande de su tipo en el mundo con más de 140,000 usuarios de más de 175 países.
Ella y su equipo constantemente lo están agregando, y "regularmente desarrollan nuevas tecnologías de inteligencia artificial que ayudan a los científicos a hacer predicciones y diseñar experimentos", agrega.
La Dra. Kat Arney, directora de información científica de Cancer Research UK, dice que cualquier cosa que reduzca el tiempo y el costo en la búsqueda de nuevos tratamientos para el cáncer ayudará a traer la próxima generación de medicamentos a los pacientes incluso antes, y señala:
"Esta base de datos pone a disposición de científicos de todo el mundo gran cantidad de información científica detallada sobre el cáncer, y acelerará los avances cruciales en el descubrimiento de fármacos, y en última instancia, salvará más vidas".
La base de datos canSAR está disponible en línea a través del ICR.
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