Identidad genética del tumor no revelada por una sola biopsia

Tomar una muestra de biopsia de un tumor puede no ser suficiente para revelar su identidad genética completa, de acuerdo con un estudio revolucionario de Cancer Research UK publicado en el New England Journal of Medicine el viernes 8 de marzo. El estudio es significativo porque sugiere que confiar en una muestra podría pasar por alto biomarcadores importantes que ayudan a hacer que los tratamientos a medida sean eficaces, lo que explica quizás por qué la terapia personalizada contra el cáncer ha tenido menos éxito de lo esperado.
El profesor Peter Johnson, jefe clínico de Cancer Research UK, dijo en un comunicado que el estudio destaca "diferencias importantes que existen dentro de los tumores y sugiere una forma de mejorar la tasa de éxito de los medicamentos personalizados contra el cáncer".
El autor principal del estudio es el profesor Charles Swanton, que trabaja en el London Research Institute de Cancer Research UK y el UCL Cancer Institute. Él y sus colegas analizaron la variación genética entre las diferentes regiones del mismo tumor canceroso, utilizando muestras donadas por pacientes con cáncer de riñón avanzado.
Esta es la primera vez que se utiliza el análisis de todo el genoma para esto.
Swanton dijo a la prensa que los científicos han sabido por un tiempo que un tumor es un "mosaico" de fallas, pero esta es la primera vez que, gracias a la tecnología de secuenciación genómica de vanguardia, los científicos han podido mapear el paisaje genético de un tumor en tal "exquisito detalle".
Para el estudio, él y sus colegas compararon las variaciones genéticas en muestras tomadas de diferentes regiones de cuatro tumores renales separados. También tomaron muestras de otros órganos a los que se había extendido el cáncer.
Descubrieron que aproximadamente dos tercios de las fallas genéticas en un tumor no se repitieron en otras muestras de biopsia del mismo tumor.
Descubrieron 118 mutaciones diferentes:

• 40 fueron "mutaciones ubicuas", es decir, estuvieron presentes en todas las muestras de biopsia,
• 53 fueron "mutaciones compartidas", es decir, estuvieron presentes en más de una, pero no en todas las muestras, y
• 25 fueron "mutaciones privadas", que solo se encontraron en una sola biopsia.

"Esto ha revelado una cantidad extraordinaria de diversidad, con más diferencias entre las biopsias del mismo tumor a nivel genético que las similitudes", dijo Swanton.
Los pacientes que donaron las muestras utilizadas en el estudio fueron tratados en el Royal Marsden Hospital de Londres bajo la supervisión del coautor Dr. James Larkin.

Larkin dijo que el estudio tiene implicaciones para la medicina personalizada, que adapta el tratamiento para pacientes individuales. Los resultados muestran que existen diferencias moleculares significativas entre las distintas partes de un tumor y también revelan diferencias entre los tumores primarios y las células cancerosas que se han diseminado a otros sitios.
Dijo que tales hallazgos podrían ser "relevantes para la forma en que tratamos el cáncer de riñón con medicamentos porque los cambios moleculares que impulsan el crecimiento del cáncer una vez que se ha diseminado pueden ser diferentes de los que impulsan el crecimiento del tumor primario".
Los investigadores también analizaron la ubicación de las mutaciones compartidas en relación con el tumor completo. A partir de esto, rastrearon el origen de subtipos particulares de células cancerosas, para identificar las mutaciones clave del conductor para hacer un "mapa" de cómo las variaciones de genes en el tumor pueden haber evolucionado.
Swanton dijo que esta es la primera vez que pueden usar el patrón de fallas genéticas en un tumor para encontrar los orígenes de ciertas poblaciones de células cancerígenas. Dijo que era como el "árbol de la vida" de Charles Darwin, que muestra cómo se relacionan las diferentes especies.
La clave es encontrar las mutaciones en el "tronco" del árbol, porque estas son las comunes, a diferencia de aquellas en las ramas remotas, que solo pueden estar presentes en una minoría de células cancerosas.

Tal enfoque "también puede explicar por qué la cirugía para extirpar el tumor renal primario puede mejorar la supervivencia, al disminuir la probabilidad de que haya células resistentes que podrían volver a desarrollar el tumor después del tratamiento", dijo Swanton.
Johnson dijo en Cancer Research UK's Genomics Initiative que van a ver si los mismos resultados ocurren con grupos más grandes de pacientes. La Iniciativa es una serie de proyectos innovadores donde los científicos utilizarán las últimas máquinas de secuenciación de genes de alta tecnología para rastrear las fallas genéticas que provocan diferentes tipos de cáncer.
El estudio fue financiado por Cancer Research UK, Medical Research Council y Wellcome Trust.
Escrito por Catharine Paddock PhD