Coincidencia de pacientes con ensayos de cáncer impulsados ??por biomarcadores - La secuenciación genética podría ayudar

Los investigadores del cáncer están desarrollando un catálogo de objetivos potenciales para nuevos tratamientos mientras continúan identificando mutaciones genéticas que impulsan diferentes subtipos de cáncer.
Recientemente, el Centro Integral de Cáncer de la Universidad de Michigan y el Centro de Patología Traslacional de Michigan (MCTP) completaron una investigación piloto. El objetivo del estudio fue resolver los desafíos prácticos que enfrentan los investigadores en la secuenciación rápida y sistemática del material genético de las personas que padecen cáncer avanzado o resistente al tratamiento para que se puedan combinar con los ensayos clínicos existentes basados ??en los biomarcadores identificados. Los hallazgos de la investigación exploratoria, conocida como Michigan Oncology Sequencing Project (MI-ONCOSEQ) se publican en Ciencia de medicina traslacional.
El investigador co-líder, el Dr. Dan Robinson, un becario postdoctoral en MCTP, explica:

"Estamos hablando de algo más que de examinar algunos genes donde se sabe que ocurren mutaciones, o incluso alrededor de cien genes. Estamos hablando de la capacidad de secuenciar más de 20,000 genes y no solo de mutaciones genéticas individuales, sino en combinaciones de mutaciones ".

Los investigadores descubrieron que identificar el "paisaje mutacional" de una persona ofrece una técnica prometedora para determinar qué ensayos podrían ayudar mejor a un paciente.
El investigador co-líder, Dr. Sameek Roychowdhury, profesor clínico en hematología y oncología en la Facultad de Medicina U-M, dice:

"La secuenciación de alto rendimiento aprovecha los últimos avances tecnológicos para procesar millones de piezas de información genética, lo que nos permite mapear las aberraciones genéticas de un cáncer. El uso de esta técnica para identificar opciones de tratamiento impulsadas por biomarcadores realmente abre la puerta a la oncología personalizada, pero también presenta una serie de desafíos logísticos, entre los que destacan los resultados disponibles de forma rentable y en un marco de tiempo clínicamente relevante.
Hace una o dos décadas, este tipo de secuenciación habría costado muchos millones o incluso miles de millones de dólares, pero la tecnología avanza tan rápido que ahora hablamos en términos de miles, lo que hace que el uso generalizado sea una posibilidad real ".

El cáncer puede provenir de una serie de cambios genéticos, que incluyen adiciones, eliminaciones, reordenamientos y sustituciones dentro del código genético.
Roychowdhury, afirma:

"Se requieren diferentes procesos de secuencia para encontrar diferentes tipos de alteraciones. Pero para ser rentable, debe haber un acto de equilibrio entre un análisis amplio y un análisis profundo".

Los investigadores comenzaron examinando el enfoque de secuenciación de los investigadores en tumores de cáncer de próstata que se habían cultivado en ratones. Más tarde, el estudio inscribió a dos personas en un piloto clínico: un paciente con cáncer colorrectal y otro con melanoma. Para ambos participantes, se identificaron posibles ensayos clínicos.
Sin embargo, los investigadores advierten que no todas las personas coincidirán con un estudio existente. Algunos con cierta mutación pueden ser excluidos ya que tienen, por ejemplo, cáncer de próstata, pero un ensayo solo está inscribiendo a personas con cáncer de mama. Según los investigadores, este método también brinda la oportunidad de abordar los ensayos clínicos de una forma novedosa, pasando de un enfoque específico de los tejidos hacia las aberraciones genéticas compartidas entre los diferentes tipos de cáncer.
Advierten que inscribirse en un ensayo no garantiza que el individuo se beneficie del tratamiento.
Los obstáculos para una implementación extensa incluyen la necesidad de una Junta de Tumor Secuencial multidisciplinar para interpretar los complejos resultados de secuenciación, administrar los recursos computacionales necesarios, así como un método para tratar los descubrimientos genéticos incidentales revelados por la secuenciación, como un riesgo de hemocromatosis, un trastorno genético en que el cuerpo absorbe demasiado hierro

Es vital lograr un tiempo de respuesta de cuatro semanas para los resultados, ya que ese es el período de tiempo en que a las personas generalmente se les exige esperar a que los tratamientos no exitosos salgan de sus sistemas antes de comenzar un ensayo clínico.
El investigador principal Dr. Arul Chinnaiyan, director de MCTP, Howard Hughes Medical Institute Investigator, y S.P. Hicks Professor de Patología en la U-M Medical School, dice:

"Una vez que se eliminen algunos de los obstáculos prácticos y tecnológicos, visualizamos una variedad de ensayos basados ??en mutaciones y vías para terapias dirigidas disponibles, con elegibilidad basada en la evaluación molecular. Además, si los pacientes son tratados con terapias dirigidas coincidentes y desarrollan resistencia secundaria, también podría ayudar a revelar los mecanismos de resistencia e informar futuros ensayos de terapias combinadas ".

Según Chinnaiyan, el trabajo solo fue posible gracias a la colaboración y el trabajo en equipo. Los médicos de U-M, el Dr. Moshe Talpaz, el Dr. Stephen Gruber y el Dr. Kenneth Pienta desempeñaron papeles vitales en la implementación clínica de este protocolo exploratorio, señala.
El equipo espera que en los próximos 5 a 10 años este tipo de secuenciamiento esté más ampliamente disponible. Se alienta a los pacientes de cáncer a hablar con sus médicos sobre oportunidades de ensayos clínicos.
Escrito por Grace Rattue