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Lanzamiento del enorme catálogo de ADN sobre el cáncer infantil
Al lanzar un gran catálogo de datos completos de ADN sobre cánceres infantiles a la comunidad científica mundial, un equipo del Hospital de Investigación Infantil St Jude en Memphis, Tennessee, Estados Unidos, espera acelerar el progreso en la búsqueda de causas y nuevos tratamientos para el cáncer y otras enfermedades enfermedades.
El catálogo contiene secuencias completas del genoma, esencialmente mapas de ADN completos, de 260 pacientes con cáncer infantil. Hay 520 secuencias en total, que comprenden conjuntos combinados de muestras de tejido normal y tumoral.
Los científicos que publicaron los datos están trabajando en el Proyecto del Genoma del Cáncer Pediátrico de la Universidad de Washington, que se espera secuenciará más de 1,200 genomas a fines de este año.
El lanzamiento, que se considera el más grande de su tipo para la comunidad científica, se anunció como parte de un artículo de Perspective publicado en Genética de la naturaleza el martes.
Para garantizar la máxima precisión de los datos, cada muestra se secuencia 30 veces.
La información será valiosa no solo para los investigadores en el campo del cáncer, sino también para los científicos que investigan todo tipo de enfermedades.
Los investigadores de St Jude están buscando identificar las diferencias entre los genomas de las células sanas y cancerosas para identificar las causas de más de media docena de cánceres infantiles mortales.
Su trabajo ya ha producido varios descubrimientos importantes, sobre los que han escrito en importantes revistas científicas.
Algunos de estos descubrimientos incluyen ideas significativas sobre los cánceres infantiles agresivos de la retina, el tronco del encéfalo y la sangre. Por ejemplo, mientras se investiga qué hay detrás del rápido desarrollo del retinoblastoma tumoral ocular, los investigadores del proyecto identificaron un nuevo agente prometedor contra el cáncer.
En otra parte del proyecto, los científicos que estudian una leucemia infantil mortal llamada ETP-ALL (abreviatura de leucemia linfoblástica temprana precursora T precursora) descubrieron algunas diferencias inesperadas en el genoma que podrían mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los niños con la enfermedad.
James Downing es un director científico de St Jude y líder del proyecto en St Jude. Él le dijo a la prensa que estos hallazgos, y otros, no hubieran sido posibles sin el Proyecto del Genoma del Cáncer Pediátrico, y:
"Al compartir la información ... esperamos que otros investigadores puedan utilizar este recurso enriquecido para obtener información sobre muchos otros tipos de enfermedades en niños y adultos", dijo.
El Proyecto del Genoma del Cáncer Pediátrico es diferente porque a diferencia de muchos proyectos del genoma, está produciendo conjuntos de datos del genoma completo, que muestran secuencias de ADN completas, en lugar de centrarse en genes individuales.
Dichos conjuntos de datos ofrecen una imagen mucho más rica y completa de los cambios en el ADN detrás de las causas y la progresión de la enfermedad.
Richard K Wilson, director del Instituto Genoma de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington en San Luis, dijo que con este enfoque encontraron algunos cambios inusuales y "crípticos" en las células cancerosas de muchos pacientes que no habrían encontrado utilizando otros métodos.
El proyecto también ha demostrado que existen algunas diferencias marcadas entre los cánceres de niños y adultos, lo que subraya por qué es importante desarrollar tratamientos separados para cada uno.
Los investigadores podrán acceder a los datos en línea mediante el envío de una solicitud al European Genome-Phenome Archive.
Escrito por Catharine Paddock PhD
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