"Primer" del clínico para la secuenciación del genoma y del exoma publicado

Algunos podrían cuestionar si la secuenciación del genoma, y ??su secuenciación del exoma de la versión reducida, están listos para pasar del laboratorio a la clínica. Los expertos advierten que los médicos no saben lo suficiente sobre genética para comprender las fortalezas y debilidades de tales herramientas.

Pero los médicos ya han ordenado varios miles de exámenes, particularmente para ayudar con casos de enfermedades infantiles raras, lo que sugiere que, ya sea que esté lista o no, la tecnología ya ha entrado en el ámbito de la práctica médica general.

La transición ha sido más rápida de lo esperado, y es probable que aumente el uso del genoma clínico o la secuenciación del exoma (CGES), según los Dres. Leslie G. Biesecker y Robert C. Green, dos destacados científicos de EE. UU. Que han esbozado lo que los médicos necesitan saber para utilizar la nueva tecnología de manera efectiva. Su "primer" se publica como un informe en el New England Journal of Medicine.

El Dr. Biesecker, jefe de la Rama de Genómica Médica y Genética Metabólica del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI) en Bethesda, MD, dice que "las tecnologías que se utilizaron para el Proyecto del Genoma Humano ahora se destilan a herramientas prácticas que los médicos pueden usar para diagnosticar y, con suerte, tratar enfermedades en pacientes que antes no podían tratar ".

Él dice que la tecnología ha llegado y se desarrolló más rápido, y se ha vuelto más útil en la clínica de lo que cualquier persona razonable podría haber esperado hace 10 años, cuando era poco probable que "alguien te hubiera tomado en serio si dijeras eso en 2014, decenas de miles de pacientes obtendrían genoma clínico y secuenciación del exoma ".

El Dr. Green, quien lidera un proyecto CGES financiado por NHGRI y varios otros proyectos de investigación de genómica traslacional en el Hospital Brigham and Women's y la Facultad de Medicina de Harvard en Boston, MA, dice: "Este es un momento transformador en la historia de la medicina cuando comenzamos a integrar la secuenciación del genoma en el cuidado de los pacientes ".

El manual se centra en casos difíciles de diagnosticar

Explica que si bien el enfoque de la cartilla es sobre el uso de CGES en casos donde el diagnóstico es difícil, "la secuencia es solo el comienzo. Podemos esperar que estas tecnologías nos ayuden a transitar todo nuestro enfoque en medicina a una atención más personalizada y preventiva "

La secuenciación del genoma busca diferencias, a nivel de "letras" individuales o pares de bases en el ADN, entre el genoma de un paciente y un genoma de referencia para encontrar "variaciones" o "mutaciones" que pueden causar enfermedad o afectar el riesgo de enfermedad. La secuenciación del genoma se dirige a 3.000 millones de pares de bases del genoma humano.

La secuenciación del exoma es una versión "reducida" o abreviada de la secuenciación del genoma. Lleva a cabo la misma comparación, pero en una cantidad mucho más pequeña de ADN: el 1-2% que codifica las proteínas y representa alrededor de 20,000 genes.

A veces, la manera más rápida y barata de buscar variantes o mutaciones que causan enfermedades es observar solo el exoma.

En 2013, el NEJM publicó un estudio financiado por NHGRI que mostró cómo la secuenciación del exoma identificó la causa genética de la enfermedad en aproximadamente el 25% de los pacientes.

La secuenciación del exoma ha identificado variantes genéticas que causan o contribuyen a muchas enfermedades, incluyendo epilepsia, miocardiopatía, trastornos metabólicos, cáncer, esclerosis lateral amiotrófica (ELA o enfermedad de Lou Gehrig), enfermedad de Charcot-Marie-Tooth, retraso mental y otras neuropatías.

Los médicos necesitan comprender lo que CGES puede y no puede hacer

Sin embargo, existe el peligro de que debido a que la nueva tecnología sea tan poderosa que los médicos puedan tener la impresión de que responderá a todas sus preguntas. Los autores advierten que los médicos deben comprender que no puede hacer eso y que puede no ser apropiado para todos los pacientes.

La guía preliminar establece lo que los médicos necesitan saber y hacer para usar CGES correctamente. Por ejemplo:

• Aunque a veces se denomina secuenciación de "genoma completo" o "exoma completo", las tecnologías no cubren el 100% del genoma o el exoma. La tecnología funciona mejor cuando se buscan alteraciones en secuencias que comprenden de ocho a 10 pares de bases, por lo que es posible que no capten variaciones o repeticiones más largas que puedan ser responsables de una enfermedad genética.
• La tecnología parece ser la más adecuada para pacientes con desórdenes raros causados ??por variantes en genes individuales. Los médicos deben analizar los antecedentes familiares para detectar trastornos similares y realizar búsquedas extensas en la literatura antes de ordenar CGES a los pacientes. Además, deben asegurarse de obtener el consentimiento informado.
• No espere que la secuenciación del exoma proporcione un diagnóstico. La mayoría de las pruebas no arrojan ningún resultado; solo el 25% de ellas encuentran en promedio una variante genética que puede causar o aumentar el riesgo de enfermedad. Por el contrario, un resultado negativo no significa que no haya una causa genética.
• En la mayoría de los casos, identificar una causa genética no conduce a una cura. Pero esto no significa necesariamente que la prueba haya sido una pérdida de tiempo y dinero; puede haber evitado que el paciente se sometiera a procedimientos de diagnóstico alternativos invasivos y estresantes.
• La prueba puede descubrir variantes genéticas para enfermedades que no están relacionadas con el trastorno primario del paciente.
• Es esencial que los pacientes y sus familias tengan asesoramiento. Esto puede preparar a los pacientes para la posibilidad de una decepción, ya que la prueba, que puede ser costosa, puede no ayudar a los médicos a llegar a un diagnóstico o proporcionar una respuesta concluyente.

Los autores dicen que no está claro si las aseguradoras pagarán todos o parte de los costos de las pruebas CGES, aunque el Dr. Biesecker dice que ha escuchado informes de algunos laboratorios que las aseguradoras están reembolsando por ellos.

En un comentario final, él dice que los médicos que piensan en usar CGES deberían aprender qué enfermedades pueden o no pueden manejar las pruebas, qué historias familiares sugieren una causa de un solo gen y cómo interpretar resultados ambiguos e insta a:

"Si estás dispuesto a aprender esas cosas, creo que puedes utilizar la prueba clínicamente. Si no estás dispuesto a aprender esas cosas, probablemente no deberías ordenar la prueba, y probablemente debas derivar al paciente a alguien. quien está dispuesto a aprender estas cosas ".

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